داستان سریال پنگوئن روایت صعود Oswald Cobblepot معروف به پنگوئن است که پس از وقایع فیلم بتمن 2022 میگذرد. در زمانی که شهر گاتهام پس از انفجار بزرگ و نابودی دیوار ساحلی در آشوب فرو رفته، پنگوئن در این حین متوجه فرصتی برای قدرت‌یابی می‌شود و با زیرکی و بی‌رحمی، تلاش می‌کند با دستکاری مافیای گاتهام و دشمن‌سازی بین گروه‌ها، کنترل دنیای جنایت در شهر را به دست گیرد.